El Nuevo Hospital Universitario de Cuenca cuenta con una superficie total construida de 114.704 m². Dispone de 148 consultas externas, 40 boxes de urgencias, 11 salas de radiodiagnóstico, 12 quirófanos de cirugía general y 4 quirófanos ambulatorios, a lo que se suma un aparcamiento en superficie con 1.000 plazas y un helipuerto.
Desde el punto de vista arquitectónico, el hospital se organiza sobre un basamento común de cuatro plantas, a partir del cual se desarrollan cuatro volúmenes rectangulares en forma de peine, arrancando desde el nivel 2 y elevándose hasta el nivel 7, lo que permite optimizar la funcionalidad y la distribución de los servicios. Infraestructura de vanguardia y tecnología avanzada.
El hospital incorpora una amplia dotación asistencial, incluyendo 508 camas de hospitalización, de las cuales el 75% son de uso individual, 16 quirófanos, 120 consultas y gabinetes, 44 boxes de urgencias, 16 boxes de rehabilitación, 33 puestos de hospital de día oncohematológico, 24 puestos de nefrología y diálisis, 20 puestos de hospital de día, 22 puestos de UCI, espacios específicos para formación e investigación y helipuerto con acceso directo a quirófano, UCI y urgencias.